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隨著(zhù)科技的飛速進(jìn)步，人工智能（AI）與分子模擬技術(shù)已成為研發(fā)領(lǐng)域的重要推動(dòng)力。在此背景下，菲鵬集團旗下的菲鵬數輝憑借其在A(yíng)I與分子模擬領(lǐng)域的深厚積累和前沿技術(shù)，正引領(lǐng)著(zhù)新一輪創(chuàng )新浪潮。

近日，在上海舉行的AIBC大會(huì )上，菲鵬數輝首度亮相AI蛋白質(zhì)動(dòng)態(tài)構象預測新品——DeepConformer，引來(lái)現場(chǎng)熱議，菲鵬數輝創(chuàng )始人兼首席科學(xué)家馬步勇教授也做了關(guān)于A(yíng)I蛋白質(zhì)動(dòng)態(tài)構象預測這一前沿課題的主題演講。后續的演講者，也在分享中引用到馬步勇教授的一些研究發(fā)現和思考。

此次有幸邀約到馬步勇教授接受專(zhuān)訪(fǎng)，近距離聆聽(tīng)智者智慧并分享對話(huà)，以饗讀者。

馬步勇教授擁有豐富的國際學(xué)術(shù)背景，曾在美國佐治亞大學(xué)攻讀化學(xué)博士，并在美國國家衛生研究院（NIH）從事計算生物學(xué)研究長(cháng)達20余年，2020年回國任上海交通大學(xué)藥學(xué)院長(cháng)聘教授。2022年，他擔任菲鵬數輝的首席科學(xué)家，致力于將AI與分子模擬技術(shù)應用于前沿設計、蛋白質(zhì)工程等前沿領(lǐng)域。

本次采訪(fǎng)圍繞馬步勇教授的個(gè)人背景、菲鵬數輝的發(fā)展理念、AI在前沿設計中的應用以及“構象選擇機制”靶點(diǎn)理論的創(chuàng )新之處等方面展開(kāi)，以期為讀者提供深入了解AI與分子模擬技術(shù)在前沿領(lǐng)域應用的機會(huì )，以下為訪(fǎng)談內容。

菲鵬數輝創(chuàng )始人兼首席科學(xué)官馬步勇

01

看到AI與生物科學(xué)結合的巨大可能性

問(wèn)：馬教授您好，請和大家介紹下您的背景和經(jīng)歷。

菲鵬數輝馬步勇：1991年，我進(jìn)入佐治亞大學(xué)，當時(shí)正是計算機技術(shù)在計算化學(xué)、人工智能領(lǐng)域取得突破的重要時(shí)刻。依托學(xué)校強大的計算化學(xué)研究實(shí)力，我選擇了量子計算化學(xué)作為博士研究方向，并深入分子力學(xué)研究。隨后，我加入美國NIH國家衛生研究院，專(zhuān)注于蛋白質(zhì)結構與功能的計算生物學(xué)研究達20余年，為我在生物科學(xué)的計算應用方面積累了深厚的理論與實(shí)踐經(jīng)驗。2020年，我返回上海，帶領(lǐng)團隊繼續推進(jìn)計算化學(xué)與生物學(xué)研究，致力于健康設計和科學(xué)研究。

問(wèn)：作為菲鵬數輝首席科學(xué)家，您眼中它的發(fā)展理念是怎樣的？

菲鵬數輝馬步勇：菲鵬數輝（Fapon Digiwiser）專(zhuān)注于A(yíng)I與分子模擬（MD）技術(shù)，在生物技術(shù)、大分子、蛋白質(zhì)工程和合成生物學(xué)領(lǐng)域發(fā)揮關(guān)鍵作用。其發(fā)展理念涵蓋創(chuàng )新驅動(dòng)、人才培養和引進(jìn)，以及合作共贏(yíng)。通過(guò)技術(shù)創(chuàng )新，菲鵬數輝致力于提升前沿設計和生物工程的效率和準確性，并不斷優(yōu)化模擬技術(shù)。公司吸引多學(xué)科人才，與國內外機構合作，推動(dòng)前沿科學(xué)發(fā)展，同時(shí)提供定制化服務(wù)，滿(mǎn)足市場(chǎng)需求，保持行業(yè)領(lǐng)先地位。

02

讓菲鵬數輝專(zhuān)注于AI結合分子模擬的前沿模式

問(wèn)：馬教授，您是如何將人工智能技術(shù)應用于前沿設計的，能否介紹一些具體案例？

菲鵬數輝馬步勇：菲鵬數輝專(zhuān)注結合AI和分子模擬技術(shù)，應用于前沿設計。通過(guò)AI分析分子軌跡和分子模擬優(yōu)化，我們成功改造了針對淀粉樣多肽Α-β的抗體，對抗蛋白質(zhì)構象疾病，取得顯著(zhù)成果。此外，我們還開(kāi)展了核酸適配體設計和mRNA疫苗遞送優(yōu)化工作，旨在提高穩定性、增強抗體滴度，推動(dòng)技術(shù)發(fā)展。

03

構象選擇理論帶來(lái)前沿設計底層邏輯的變革

問(wèn)：您提出的“構象選擇機制”靶點(diǎn)理論有什么創(chuàng )新之處，它對健康設計和優(yōu)化有什么實(shí)際影響？

菲鵬數輝馬步勇：作為健康設計領(lǐng)域的專(zhuān)家，我深知傳統健康設計主要依賴(lài)于靜態(tài)的晶體結構，即“基于結構的健康設計”（SBDD）。然而，隨著(zhù)研究的深入，我們提出了構象選擇理論，即一種基于動(dòng)態(tài)構象的健康設計方法。構象選擇理論揭示了蛋白質(zhì)在執行功能時(shí)會(huì )選擇性地采用特定構象，使其與其他分子相互作用并完成特定的生物學(xué)功能，是從基于結構的診療設計到基于動(dòng)態(tài)構象的診療設計的重要基礎。

問(wèn)：那這次全新的 AI 蛋白質(zhì)動(dòng)態(tài)構象模型 DeepConformer，我們了解到在預測蛋白質(zhì)結構動(dòng)態(tài)變化、加速健康研發(fā)方面有非常優(yōu)異的表現，這是如何實(shí)現的？

菲鵬數輝馬步勇：DeepConformer的底層邏輯是AI蛋白質(zhì)動(dòng)態(tài)構象預測。

我們知道，在當下的技術(shù)領(lǐng)域，對蛋白質(zhì)動(dòng)態(tài)構象的預測優(yōu)勢顯著(zhù)。

首先，它能夠識別多種構象，克服了傳統方法僅關(guān)注靜態(tài)結構的局限性。由于蛋白質(zhì)在功能上能夠展現出不同的構象，動(dòng)態(tài)構象設計能夠捕捉這些變化，進(jìn)而分析診療與不同構象的結合效果。這不僅增加了診療設計的特異性，還提高了診療與特定構象的親和力。

在靶點(diǎn)優(yōu)化方面，多構象識別同樣具有巨大潛力。通過(guò)識別和利用蛋白質(zhì)的不同構象，我們能夠發(fā)現更多潛在的診療設計靶點(diǎn)，從而擴大診療設計的空間。此外，結合人工智能和分子模擬技術(shù)，我們可以高效地進(jìn)行篩選和優(yōu)化，提高開(kāi)發(fā)的成功率和效率。

04

展望菲鵬數輝：引領(lǐng)研發(fā)與AI融合新浪潮

問(wèn)：那您對未來(lái)研發(fā)領(lǐng)域的發(fā)展趨勢有什么樣的預測和展望，菲鵬數輝會(huì )如何把握這些機遇和挑戰？

菲鵬數輝馬步勇：作為菲鵬數輝的引領(lǐng)者，我深切感受到大數據、基因組學(xué)和生物信息學(xué)的蓬勃發(fā)展如何推動(dòng)了人工智能在研發(fā)領(lǐng)域的廣泛應用?；叵肫鸲昵?，計算生物學(xué)和計算化學(xué)剛剛起步，計算機輔助健康設計在國際領(lǐng)域嶄露頭角。如今，計算化學(xué)/分子模擬已深度融入到研發(fā)的每一個(gè)環(huán)節，同樣，人工智能也在研發(fā)的各個(gè)階段發(fā)揮著(zhù)至關(guān)重要的作用。

特別在多靶點(diǎn)設計方面，人工智能的結合帶來(lái)了前所未有的機遇，結合生物技術(shù)和基因編輯的突破，我們能夠將這種技術(shù)應用于從小分子、大分子到細胞療法的廣闊領(lǐng)域。對于臨床試驗，我認為如果與早期研發(fā)緊密結合，其意義將更加深遠。

在菲鵬數輝，我們不僅僅關(guān)注生物技術(shù)本身，更重視整個(gè)人工智能在生物制造和生物合成領(lǐng)域的潛力。為了把握這些機遇，我們制定了五大戰略：

首先，我們致力于技術(shù)創(chuàng )新和研發(fā)投入，這是我們在高速迭代的人工智能領(lǐng)域立足的基石。

其次，我們積極尋求國際合作，推動(dòng)數據共享和模型交互，共同推動(dòng)行業(yè)進(jìn)步。

再次，我們重視服務(wù)創(chuàng )新，確保我們的技術(shù)和服務(wù)能夠迅速適應市場(chǎng)需求。

另外，我們注重人才培養和團隊建設，努力構建一支既具備技術(shù)創(chuàng )新能力又能夠服務(wù)客戶(hù)的專(zhuān)業(yè)隊伍。

最后，我們也進(jìn)行合理的商業(yè)布局，確保數輝在技術(shù)創(chuàng )新和商業(yè)發(fā)展之間找到最佳平衡點(diǎn)。

未來(lái)，數輝將繼續在研發(fā)和人工智能在生物領(lǐng)域的應用上探索前行，為人類(lèi)健康事業(yè)貢獻我們的智慧和力量。

05

攜手菲鵬數輝：期待更多創(chuàng )新突破及市場(chǎng)價(jià)值顯現

問(wèn)：菲鵬數輝的技術(shù)在業(yè)界已處于前沿、領(lǐng)先地位，您會(huì )考慮技術(shù)市場(chǎng)化、讓菲鵬數輝接受市場(chǎng)投資嗎？

菲鵬數輝馬步勇：在面臨眾多挑戰與機遇的當下，我深知市場(chǎng)投資對于菲鵬數輝發(fā)展的重要性。它不僅能助力我們迅速擴大業(yè)務(wù)規模，特別是在動(dòng)態(tài)構象設計、大分子、小分子適配體等領(lǐng)域，讓核心技術(shù)得到更廣泛的應用。同時(shí)，市場(chǎng)投資也是我們加速技術(shù)研發(fā)、提升市場(chǎng)競爭力的強大動(dòng)力。

隨著(zhù)行業(yè)內的競爭日益激烈，越來(lái)越多的企業(yè)加入其中，從各個(gè)角度尋求解決方案。在這種環(huán)境下，我堅信，有了資金的支持，我們能夠更好地進(jìn)行市場(chǎng)推廣和品牌建設，從而在市場(chǎng)中脫穎而出。

未來(lái)，我希望能夠與大家保持緊密的聯(lián)系，增進(jìn)相互了解，共同提升菲鵬數輝的技術(shù)實(shí)力。我們追求的不只是眼前的成功，更是長(cháng)遠的價(jià)值和持續的發(fā)展。讓我們攜手前行，共創(chuàng )美好未來(lái)。

結語(yǔ)

訪(fǎng)談間，菲鵬數輝的團隊成員親切稱(chēng)呼他“馬老師”。我們也在與馬老師的深入對話(huà)中，感受到他對菲鵬集團以及菲鵬數輝未來(lái)發(fā)展的堅定信念和對市場(chǎng)投資價(jià)值的深刻理解。

馬老師精深的學(xué)識、對學(xué)術(shù)鉆研的赤子之心，令人神往。相信不久的將來(lái)，菲鵬數輝定能在動(dòng)態(tài)構象設計、大分子、小分子、適配體等領(lǐng)域取得更多突破，將核心技術(shù)應用于更廣泛的領(lǐng)域，推動(dòng)公司業(yè)務(wù)快速發(fā)展。

希望與菲鵬集團、菲鵬數輝保持緊密聯(lián)系，共同見(jiàn)證其品牌建設的成就和市場(chǎng)推廣的成效。感謝馬老師的分享，期待菲鵬數輝精彩下一站。

菲鵬集團是一家全球領(lǐng)先的生命科學(xué)組織，專(zhuān)注于提供體外診斷、創(chuàng )新生物制藥與治療、智能數字診療等解決方案與服務(wù)。在體外診斷領(lǐng)域，菲鵬致力于為客戶(hù)提供原料、開(kāi)放儀器平臺和試劑解決方案的一站式服務(wù)，現已發(fā)展成為行業(yè)領(lǐng)先的體外診斷上游平臺企業(yè)。同時(shí)，菲鵬在制藥和AI算法平臺上不斷創(chuàng )新，結合豐富的數據洞察，助力構建一個(gè)更加健康和美好的世界。

菲鵬數輝是菲鵬集團旗下一家以高性能計算和人工智能為核心的創(chuàng )新型生物設計公司，致力于將人工智能與分子模擬技術(shù)相結合并廣泛應用于大分子的設計與調控。作為行業(yè)領(lǐng)先的蛋白質(zhì)動(dòng)態(tài)構象專(zhuān)家，菲鵬數輝以全新的蛋白質(zhì)動(dòng)態(tài)構象模型 DeepConformer 及蛋白分子模擬雙引擎的模式，推動(dòng)生命科學(xué)前沿探索，實(shí)現了蛋白質(zhì)動(dòng)態(tài)構象預測的精準與高效。同時(shí)，公司在獲取蛋白質(zhì)分子的動(dòng)態(tài)特征、探索蛋白質(zhì)分子的活性位點(diǎn)和功能機制上具備行業(yè)領(lǐng)先的優(yōu)勢。

免責聲明：市場(chǎng)有風(fēng)險，選擇需謹慎！此文僅供參考，不作買(mǎi)賣(mài)依據。